序号　保护区名称　行政区域　面积(公顷)　主要保护对象　类型　级别　始建时间　主管部门
新01　卡拉麦里山　阜康市　1423558　野驴等有蹄类野生动物及其生境　野生动物　省级　19820408　林业
新02　天池　阜康市　38069　森林生态系统、高山湖泊　森林生态　省级　19800601　林业
新03　奇台荒漠类草地　奇台县　38600　荒漠生态系统及荒漠草原生态系统　荒漠生态　省级　19860705　农业
新04　夏尔希里　博乐市　31400　森林及野生动物资源　森林生态　省级　20000616　林业
新05　艾比湖湿地　精河县　267085　湿地及珍稀野生动植物　内陆湿地　国家级　20000616　林业
新06　温泉北鲵　温泉县　695　新疆北鲵及其生境　野生动物　省级　19971229　林业
新07　罗布泊野骆驼　巴音郭楞蒙古自治州　7800000　野骆驼及其生境　野生动物　国家级　19860901　环保
新08　塔里木胡杨　尉犁县　395420　胡杨、灰杨林　荒漠生态　国家级　19830101　林业
新09　阿尔金山　若羌县　4500000　有蹄类野生动物及高原生态系统　荒漠生态　国家级　19830101　环保
新10　中昆仑　且末县　3200000　藏羚羊等野生动物　野生动物　省级　20010101　林业
新11　巴音布鲁克　和静县　100000　天鹅等珍稀水禽、沼泽湿地　野生动物　国家级　19800509　林业
新12　托木尔峰　温宿县　237600　森林及野生动植物　森林生态　国家级　19800601　林业
新13　帕米尔高原湿地　阿克陶县　125600　典型高原湿地生态系统　内陆湿地　省级　20050101　林业
新14　塔什库尔干野生动物　塔什库尔干塔吉克自治县　1500000　雪豹、盘羊等高山野生动物　野生动物　省级　19840508　林业
新15　伊犁小叶白蜡　伊宁县　405　小叶白蜡树及其生境　野生植物　省级　19830101　林业
新16　霍城四爪陆龟　霍城县　27000　四爪陆龟及其生境　野生动物　省级　19830101　林业
新17　巩留野核桃　巩留县　1180　野核桃及其生境　野生植物　省级　19830101　林业
新18　西天山　巩留县　31217　雪岭云杉林森林生态系统　森林生态　国家级　19831002　林业
新19　新源山地草甸类草地　新源县　65300　草原草甸、野生牧草近缘种　草原草甸　省级　19860705　农业
新20　甘家湖梭梭林　乌苏市　54667　梭梭林及其生境　荒漠生态　国家级　19830901　林业
新21　塔城巴尔鲁克山　裕民县　115000　野巴旦杏及其生境　野生植物　省级　19800101　林业
新22　额尔齐斯河科克托海湿地　阿勒泰地区　99040　河流湿地、湖泊湿地、沼泽湿地动植物资源　内陆湿地　省级　20050201　林业
新23　克科苏湿地　阿勒泰地区　30667　湿地及动植物资源　内陆湿地　省级　20010901　林业
新24　两河源头　阿勒泰地区　1130000　森林、动植物、湿地　森林生态　省级　20010901　林业
新25　哈纳斯　布尔津县　220162　森林生态系统及自然景观　森林生态　国家级　19800501　林业
新26　金塔斯山地草原　福海县　56700　山地草原生态系统　草原草甸　省级　19860503　农业
新27　布尔根河狸　青河县　5000　河狸及其生境　野生动物　省级　19800601　林业